A planície inundável do Pantanal é uma formação relativamente recente, no centro da América do Sul, que abriga muitas espécies originárias de outras partes do continente. Dentre os mamíferos do Pantanal, Chiroptera é a ordem mais rica, com 65 espécies registradas pelo meno uma vez. Artibeus planirostris (Phyllostomidae), Noctilio albiventris (Noctilionidae), Molossus molossus (Molossidae) e Myotis nigricans (Vespertilionidae) estão entre as espécies mais comuns e amplamente distribuídas na planície. Por outro lado, espécies incomuns tem sido registradas em regiões adjacentes às suas áreas de distribuição geográfica fora do Pantanal. Comparativamente a outras regiões, o Pantanal apresenta baixa diversidade e grande abundância sazonal de itens consumidos por filostomídeos, fatores que contribuem para o aumento da sobreposição alimentar entre esses morcegos. Em contraste aos filostomídeos, principalmente dependentes de manchas florestais, morcegos de outras famílias são predominantemente insetívoros aéreos associados a áreas abertas. A ausência de espécies endêmicas e a ocorrência de espécies de origens geográficas diferentes, de domínios adjacentes, indicam que a planície do Pantanal representa um ecótono na América do Sul.